Алгоритм | Algorithm


В обучении нейросети может принять участие каждый.
На данном этапе у нас задача обучить нейронную сеть распознавать:
1) уровень, на котором произведен аксиальный срез
2) наружную, общую подвздошные и нижнюю полую вены

Для решения первой задачи Вам необходимо создать 13 папок, соответствующих аксиальным срезам от 12 грудного до 3 позвонка копчика (см образец в архиве Anatomy.rar). С помощью программы vdviewerLt.exe найти соответствующие аксиальные срезы на МР флебограммах своих пациентов. В каждую из 13 папок сохранить из программы vdviewerLt.exe соответствующий этой папке аксиальный срез в формате .png. Название того файла может быть произвольное, но лучше использовать фамилию пациента, написанную латиницей с суффиксом уровня (по позвонку) среза. Например, итоговый файл Пациентки Ивановой, срез на уровне 12 грудного позвонка должен выглядеть так: Ivanova_Th12.png.

Для решения второй задачи мы должны на всех аксиальных срезах нашего пациента отметить для нейронной сети вену (чтобы она ее отличила от не вены). Для этого мы создаем отдельную папку с названием ColoredVein. Далее мы открываем специально для этого созданную нами программку DICOM Converter. Программа не требует установки, руководство пользователя смотрите в отдельном вордовском файле. Срезы с отмеченными синим цветом наружной, общей подвздошной и нижней полой веной сохраняем в эту папку.
Далее все архивирует и в архив добавляем фотографии ног пациента (чем больше, тем лучше) и его данные анамнеза, результатов объективного исследования и т.п. – тоже, чем больше, тем лучше.
Этот архив отправляем на нашу, специально созданную для этой цели почту: mra@antireflux.ru

Файлы для скачивания:
1. образец определения уровня, на котором сделан срез: архив Anatomy.rar – https://cloud.mail.ru/public/33d6/iriJVoo2H
2. программа vdviewerLt.exe – https://cloud.mail.ru/public/A64s/QeKM5PYJd
3. программа DICOM Converter – https://cloud.mail.ru/public/8h1q/C7awp8bNU

Пишите, если будут вопросы.
С уважением,
Стойко Юрий Михайлович
Мазайшвили Константин Витальевич

We invite all comers to join this fantastically interesting work.
Today we created the neural network using Python to write the program. At this stage, we have the task of learning the neural network to recognize:
1) the level at which the axial section is made on MRI
2) external, common iliac and inferior vena cava on MRI

To solve the first problem, we must create 13 folders corresponding to the axial sections from the 12th thoracic to 3 vertebrae of the coccyx (see the sample in the archive Anatomy.rar). Use the vdviewerLt.exe program to find the corresponding axial sections on the MR phlebograms of your patients. In each of the 13 folders, save the axial slice in the .png format from the vdviewerLt.exe program corresponding to this folder. The name of that file can be arbitrary, but it is better to use the patient’s name written in Latin with a suffix of the level (on the vertebrae) of the cut. For example, the final file of Patient Ivanova, the cut at level 12 of the thoracic vertebra should look like this: Ivanova_Th12.png.

To solve the second problem, we need to mark a vein for all the axial sections of our patient (so that it distinguishes it from non-veins). To do this, we create a separate folder called ColoredVein. Next, we open specially for this purpose the DICOM Converter created by us. The program does not require installation, see the user’s manual in a separate vordian file. Slices with the marked blue color of the outer, common ileum and inferior vena cava are stored in this folder.
Further, all archives and archive the patient’s foot photos (the more, the better) and his history data, the results of objective research, etc. – too, the more, the better.
This archive is sent to our specially created mail for this purpose: mra@antireflux.ru

Files for download:
1. Sample of the level at which the slice is made: archive Anatomy.rar – https://cloud.mail.ru/public/33d6/iriJVoo2H
2. program vdviewerLt.exe – https://cloud.mail.ru/public/A64s/QeKM5PYJd
3. DICOM Converter program – https://cloud.mail.ru/public/8h1q/C7awp8bNU

Write, if you have any questions.
Yours faithfully,
Yury Stoyko,
Konstantin Mazaishvili

Добавить комментарий